COVID-19 PCR Testi Veri Analizinde CAtenA Smart PCR Bioinformatik Programının Sunduğu Ön Değerlendirme Sonuçlarının Uzman Sonuçları ile Uyumunun Araştırılması
نویسندگان
چکیده
Amaç: Dünya Sağlık Örgütü tarafından COVID-19 için standart tanı yöntemi olarak bildirilen yöntemler arasında en yaygın kullanılanı, SARS-CoV-2 real time polimeraz zincir reaksiyonu (polymerase chain reaction, PCR) testidir. Yöntem uygulandıktan sonra, PCR veri dosyalarının uzman hekim analiz edilerek sonuçların web tabanlı Laboratuvar Bilgi Yönetim Sistemi’ne aktarılması gerekmektedir. Bu testlerin hızlı şekilde sonuçlandırılması ve sisteme hatasız tanı, tedavi takibi oldukça önemli bir basamaktır. CAtenA Smart programı, dosyalarını yapay zeka ile değerlendirerek onayına sunan onaylanmış sonuçları aktarabilen yerli biyoinformatik programdır. çalışmanın amacı, programı gerçekleştirilen ön değerlendirme sonuçlarının uyumunun araştırılmasıdır. Materyal-Metot: amaçla, Meram Devlet Hastanesi Laboratuvarı’nda cihazında (Bio-Rad CFX96 Touch, Singapore) çalışılmış 846 testi, kullanan PCR’ın (Ventura, Ankara, Türkiye) sunduğu açısından istatistiksel karşılaştırılmıştır. Bulgular Sonuç: programının verdiği negatif analizi %100, pozitif ise %97.7 uyum sağladığı belirlenmiştir. CAtenA’nın tekrarı önerdiği 84 test sonucunun %96.4’ü negatif; %3.6’sı sonuçlandırılmıştır. Yapılan McNemar-Bowker istatistik analizine göre anlamlı fark belirlenmiştir ( χ² = 84,2; p 0,0001). Sonuç olarak, olmadan yapılacak onaylarında düşük de olsa hatalı sonuç onaylama riski olduğu, tekrarlarının ek maliyete zaman kaybına neden olacağı düşünülmüştür. CAtenA’da kullanılan analizinin özellikle tekrarları konusunda iyileştirilmesi gerektiği önerisi getirilmiştir.
منابع مشابه
COVID-19 in Nursing Homes: The Problematic Management of Residents Without Positive COVID-19 RT-PCR
متن کامل
Yazılım Havuzu Analizi ile Tasarım-Kod Uyumluluğunun Araştırılması
Özet. Yazılım projelerinde analiz aĢamasında tanımlanan probleme çözüm üretme aĢaması olan tasarım, geliĢtiriciler tarafından yazılımı gerçekleĢtirmek üzere yürütülen kodlama sürecine girdi sağlar. Yazılım geliĢtirilirken ya da güncellenirken, kod ve tasarımın uyumlu olarak idamesi uzun vadeli bir yatırımdır ve idame ettirilebilir bir proje sonucunu doğurur. Ancak gerçek hayatta tecrübesizlik, ...
متن کاملRapid Detection of COVID-19 by RT-LAMP PCR Technique and its Comparison with Real-Time RT-PCR Method
Rapid antigen and antibody, serological tests, and RT ‑ PCR-based molecular methods are widely used for the detection of microorganisms worldwide. Objectives: This study aimed by Isothermal nucleic acid amplification techniques to detect the covid-19. Methods: In this study, 200 samples of nasopharynx and oropharynx were collected from Jamaran Heart Hospital in Tehran. Covid -19 was exami...
متن کاملcDNA amplification by SMART-PCR and suppression subtractive hybridization (SSH)-PCR.
The comparison of two RNA populations that differ from the effects of a single-independent variable, such as a drug treatment or a specific genetic defect, can identify differences in the abundance of specific transcripts that vary in a population-dependent manner. There are a variety of methods for identifying differentially expressed genes, including microarray, SAGE, qRT-PCR, and DDGE. This ...
متن کاملComparing the Diagnostic Power of Chest CT Scan and RT-PCR in Diagnosis of COVID-19
Background and purpose: Proper diagnosis of patients with COVID-19 is one of the challenges in medical centers. RT-PCR is the standard and reference test in diagnosis of patients with COVID-19. This study aimed at accelerating the correct diagnosis of COVID-19 and the diagnostic power of chest CT scan and RT-PCR. Materials and methods: This study was performed in 569 patients with COVID-19 adm...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Europan journal of science and technology
سال: 2021
ISSN: ['2148-2683']
DOI: https://doi.org/10.31590/ejosat.1024190